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php+mysql是服务器段程序，处理客户端传过来的数据，css3+html5是客户端浏览器段显示效果实现。一个是后端一个是前端。
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网站就是前端加后端，前端html，后端可以是php，jsp，asp，java等，后端又从数据库拿数据，数据库可以是mysql，SQL
server，oracle等，你说的这个只是其中的一个搭配
没有什么连接不连接的，网站就长这样子
这个就需要简单的掌握语言了：
HTML是页面前端脚本语言，mysql是数据库。要想同时运用两个技术需要借助JSP或ASP或PHP或RUBY等语言来实现。
简单的关系可以这样理解：
数据库---JSP或ASP或PHP或RUBY等语言---HTML
HTML5可以取代数据库的部分存储功能，还能完成JSP等逻辑处理。
不管是什么都要学会基础
初级：
java的基本操作，什么循环，数组，单例，继承，多态，面向对象等等
html就要学会css布局基本的样式操作
mysql基本的新增修改删除
中级：
java:spring+springMVC+mybeats 俗称的ssm框架，很多企业级项目都用到
html：jquery+bootstrap+angularjs等等，前端的框架比较多，把bootstrap搞定其他的html5都差不多
mysql：学会写存储过程和一些逻辑算法也就够啦
最后：纯手工打字不容易加点分呗
你这么问，HTML5写个前端页面，中间用servlet控制，连接到Mysql完事
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