WGCNA的TOM矩阵热图配色问题该怎么解决

WGCNA的TOM矩阵热图配色问题该怎么解决，很多新手对此不是很清楚，为了帮助大家解决这个难题，下面小编将为大家详细讲解，有这方面需求的人可以来学习下，希望你能有所收获。

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“老米”投稿：手把手10分文章WGCNA复现：小胶质细胞亚群在脑发育时髓鞘形成的作用 , 里面是有TOM矩阵热图，就是配色很奇怪。所以经常有人询问这个问题：

奇怪的配色

但是官网配色是：

WGCNA的TOM矩阵热图配色问题该怎么解决

官网配色

首先，这个差异其实并不重要，当然了这个TOM矩阵热图本身就可有可无，仅仅是因为教程里提到了而已，大部分情况下，就是凑图。

再说，这个配色问题，跟WGCNA没有关系，是R语言技巧罢了。或者说是搜索技巧：

简单的配色代码即可解决：

TOMplot(plotTOM, geneTree, moduleColors, main = "Network heatmap plot, all genes", col=gplots::colorpanel(250,'red',"orange",'lemonchiffon'))

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