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这篇文章将为大家详细讲解有关The Cancer Immunome Atlas数据库有什么用，小编觉得挺实用的，因此分享给大家做个参考，希望大家阅读完这篇文章后可以有所收获。
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肿瘤免疫疗法在多种恶性肿瘤的临床治疗上取得了显著效果，然而还是存在大部分患者对于免疫疗法没有响应的问题。为了更好的理解肿瘤和免疫细胞相互作用，科学家对来自TCGA和其他几个大型肿瘤研究项目，共20种实体瘤的NGS数据进行分析，对应文章链接如下
https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S2211124716317090
为了更好的查看分析结果，将相关数据整理成了一个数据库，网址如下
https://tcia.at/
点击每个肿瘤对应的柱状图，可以查看具体的数据，以乳腺癌BRCA为例，结果如下
列出了每个肿瘤患者的ID, 性别，年龄等信息，示意如下
点击患者ID, 可以查看详细的临床信息，示意如下
对于基因的表达量，提供了以下3种结果
gene expression boxplots
gene expression heatmaps
survival analysis
结果示意如下
使用qyanTIseq和Cibersort两款软件分析肿瘤患者的免疫细胞组分，结果示意如下
分析在某种特定的肿瘤中免疫细胞是否富集，结果示意如下
分析不同肿瘤患者的异质性，结果示意如下
分析肿瘤新抗原，结果示意如下
该数据库不仅可以查看TCGA中不同肿瘤的分析结果，其分析内容也值得我们借鉴，对于肿瘤样本的NGS数据， 可以进行基因表达与生存分析的关联分析，可以进行免疫细胞浸润分析，新抗原预测等分析内容。
关于“The Cancer Immunome Atlas数据库有什么用”这篇文章就分享到这里了，希望以上内容可以对大家有一定的帮助，使各位可以学到更多知识，如果觉得文章不错，请把它分享出去让更多的人看到。
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