扫二维码与项目经理沟通
我们在微信上24小时期待你的声音
解答本文疑问/技术咨询/运营咨询/技术建议/互联网交流
如何进行miRNA相关GO和KEGG功能分析，相信很多没有经验的人对此束手无策，为此本文总结了问题出现的原因和解决方法，通过这篇文章希望你能解决这个问题。
成都创新互联公司是一家专注于成都网站设计、网站制作与策划设计,哈密网站建设哪家好?成都创新互联公司做网站,专注于网站建设十载,网设计领域的专业建站公司;建站业务涵盖:哈密等地区。哈密做网站价格咨询:18982081108
对于mRNA数据，我们经常通过GO和KEGG富集分析来进行功能分析，对于miRNA数据而言，我们可以通过miRNA对应的mRNA来研究miRNA相关功能。
miRpath是一个在线网站，集成了miRNA靶基因数据库, 只需要输入感兴趣的miRNA Id, 就可以从靶基因数据库中获取miRNA对应的靶基因，然后进行GO和KEGG富集分析
该数据库中集成以下3个miRNA靶基因数据库
TarBase
TargetScan
microT-CDS
支持以下几个物种的GO和KEGG富集分析
Human
Mouse
D.melanogaster
C.elegans
R.Norvegicus
D.Rerio
G.Gallus
该数据库有以下两种使用方式
正向检索功能用于分析指定miRNA的功能，输入框如下所示
通过Species选择对应物种，在Add miRNAs框中输入感兴趣的miRNA ID，然后选择对应的靶基因数据库即可，kegg pathway运行结果如下所示
这个结果其实就是将输入的所有miRNA的靶基因集合进行富集分析，点击details， 可以查看每个miRNA靶基因单独富集分析结果，示意如下
点击see genes, 可以查看具体的基因列表，示意如下
点击pathway union, 通过show heatmap可以得到如下所示的热图
这种热图反应的是每个miRNA靶基因的富集分析结果，每一行代表一个miRNA, 每一列代表一个pathway, 单元格的颜色该通路下富集的p值决定。
反向检索功能用于发现调控指定的GO或者pathway下基因的miRNA, 示意如下
我们可以以miRpath作为参考，利用其他数据库或者自己构建的高质量miRNA靶基因数据来进行富集分析，从而研究miRNA相关功能。
看完上述内容，你们掌握如何进行miRNA相关GO和KEGG功能分析的方法了吗？如果还想学到更多技能或想了解更多相关内容，欢迎关注创新互联行业资讯频道，感谢各位的阅读！
我们在微信上24小时期待你的声音
解答本文疑问/技术咨询/运营咨询/技术建议/互联网交流
微信二维码
移动版官网