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gpmgo语言 gp怎么写

GPM是什么意思

GPM有多种释义,包括计量单位,著名纸模型品牌等等。在生物医学领域,GPM是The Global Proteome Machine的缩写,其支持的生物信息学开源软件项目X!Tandem在蛋白质组学方面有很强的应用性。

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另外,“GPM”也可解释为“良好的生产规范”,是药品、食品等行业强制执行的标准,是在生产过程中对产品质量及卫生安全实施自主管理的制度。

扩展资料

GPM (Global Proteome Machine)系统由GPMO(The Global Proteome Machine Organization)支持建立。

它的建立使应用串联质谱进行蛋白质组学研究的科学家,能够使用GPM数据信息来分析蛋白质组学数据。此平台由 GPMO提供并通过支持的项目来改善数据分析的质量,通过不断的测试和验证蛋白质组学结果,从而推进分析结果的便捷可靠。

GPM可针对不同类型的质谱注释信息,及时整合到分析平台中,供相关的研究人员使用。平台已整合了GO(Gene Ontology)、ENSEMBL等的数据注释。

【golang详解】go语言GMP(GPM)原理和调度

Goroutine调度是一个很复杂的机制,下面尝试用简单的语言描述一下Goroutine调度机制,想要对其有更深入的了解可以去研读一下源码。

首先介绍一下GMP什么意思:

G ----------- goroutine: 即Go协程,每个go关键字都会创建一个协程。

M ---------- thread内核级线程,所有的G都要放在M上才能运行。

P ----------- processor处理器,调度G到M上,其维护了一个队列,存储了所有需要它来调度的G。

Goroutine 调度器P和 OS 调度器是通过 M 结合起来的,每个 M 都代表了 1 个内核线程,OS 调度器负责把内核线程分配到 CPU 的核上执行

模型图:

避免频繁的创建、销毁线程,而是对线程的复用。

1)work stealing机制

当本线程无可运行的G时,尝试从其他线程绑定的P偷取G,而不是销毁线程。

2)hand off机制

当本线程M0因为G0进行系统调用阻塞时,线程释放绑定的P,把P转移给其他空闲的线程执行。进而某个空闲的M1获取P,继续执行P队列中剩下的G。而M0由于陷入系统调用而进被阻塞,M1接替M0的工作,只要P不空闲,就可以保证充分利用CPU。M1的来源有可能是M的缓存池,也可能是新建的。当G0系统调用结束后,根据M0是否能获取到P,将会将G0做不同的处理:

如果有空闲的P,则获取一个P,继续执行G0。

如果没有空闲的P,则将G0放入全局队列,等待被其他的P调度。然后M0将进入缓存池睡眠。

如下图

GOMAXPROCS设置P的数量,最多有GOMAXPROCS个线程分布在多个CPU上同时运行

在Go中一个goroutine最多占用CPU 10ms,防止其他goroutine被饿死。

具体可以去看另一篇文章

【Golang详解】go语言调度机制 抢占式调度

当创建一个新的G之后优先加入本地队列,如果本地队列满了,会将本地队列的G移动到全局队列里面,当M执行work stealing从其他P偷不到G时,它可以从全局G队列获取G。

协程经历过程

我们创建一个协程 go func()经历过程如下图:

说明:

这里有两个存储G的队列,一个是局部调度器P的本地队列、一个是全局G队列。新创建的G会先保存在P的本地队列中,如果P的本地队列已经满了就会保存在全局的队列中;处理器本地队列是一个使用数组构成的环形链表,它最多可以存储 256 个待执行任务。

G只能运行在M中,一个M必须持有一个P,M与P是1:1的关系。M会从P的本地队列弹出一个可执行状态的G来执行,如果P的本地队列为空,就会想其他的MP组合偷取一个可执行的G来执行;

一个M调度G执行的过程是一个循环机制;会一直从本地队列或全局队列中获取G

上面说到P的个数默认等于CPU核数,每个M必须持有一个P才可以执行G,一般情况下M的个数会略大于P的个数,这多出来的M将会在G产生系统调用时发挥作用。类似线程池,Go也提供一个M的池子,需要时从池子中获取,用完放回池子,不够用时就再创建一个。

work-stealing调度算法:当M执行完了当前P的本地队列队列里的所有G后,P也不会就这么在那躺尸啥都不干,它会先尝试从全局队列队列寻找G来执行,如果全局队列为空,它会随机挑选另外一个P,从它的队列里中拿走一半的G到自己的队列中执行。

如果一切正常,调度器会以上述的那种方式顺畅地运行,但这个世界没这么美好,总有意外发生,以下分析goroutine在两种例外情况下的行为。

Go runtime会在下面的goroutine被阻塞的情况下运行另外一个goroutine:

用户态阻塞/唤醒

当goroutine因为channel操作或者network I/O而阻塞时(实际上golang已经用netpoller实现了goroutine网络I/O阻塞不会导致M被阻塞,仅阻塞G,这里仅仅是举个栗子),对应的G会被放置到某个wait队列(如channel的waitq),该G的状态由_Gruning变为_Gwaitting,而M会跳过该G尝试获取并执行下一个G,如果此时没有可运行的G供M运行,那么M将解绑P,并进入sleep状态;当阻塞的G被另一端的G2唤醒时(比如channel的可读/写通知),G被标记为,尝试加入G2所在P的runnext(runnext是线程下一个需要执行的 Goroutine。), 然后再是P的本地队列和全局队列。

系统调用阻塞

当M执行某一个G时候如果发生了阻塞操作,M会阻塞,如果当前有一些G在执行,调度器会把这个线程M从P中摘除,然后再创建一个新的操作系统的线程(如果有空闲的线程可用就复用空闲线程)来服务于这个P。当M系统调用结束时候,这个G会尝试获取一个空闲的P执行,并放入到这个P的本地队列。如果获取不到P,那么这个线程M变成休眠状态, 加入到空闲线程中,然后这个G会被放入全局队列中。

队列轮转

可见每个P维护着一个包含G的队列,不考虑G进入系统调用或IO操作的情况下,P周期性的将G调度到M中执行,执行一小段时间,将上下文保存下来,然后将G放到队列尾部,然后从队列中重新取出一个G进行调度。

除了每个P维护的G队列以外,还有一个全局的队列,每个P会周期性地查看全局队列中是否有G待运行并将其调度到M中执行,全局队列中G的来源,主要有从系统调用中恢复的G。之所以P会周期性地查看全局队列,也是为了防止全局队列中的G被饿死。

除了每个P维护的G队列以外,还有一个全局的队列,每个P会周期性地查看全局队列中是否有G待运行并将其调度到M中执行,全局队列中G的来源,主要有从系统调用中恢复的G。之所以P会周期性地查看全局队列,也是为了防止全局队列中的G被饿死。

M0

M0是启动程序后的编号为0的主线程,这个M对应的实例会在全局变量rutime.m0中,不需要在heap上分配,M0负责执行初始化操作和启动第一个G,在之后M0就和其他的M一样了

G0

G0是每次启动一个M都会第一个创建的goroutine,G0仅用于负责调度G,G0不指向任何可执行的函数,每个M都会有一个自己的G0,在调度或系统调用时会使用G0的栈空间,全局变量的G0是M0的G0

一个G由于调度被中断,此后如何恢复?

中断的时候将寄存器里的栈信息,保存到自己的G对象里面。当再次轮到自己执行时,将自己保存的栈信息复制到寄存器里面,这样就接着上次之后运行了。

我这里只是根据自己的理解进行了简单的介绍,想要详细了解有关GMP的底层原理可以去看Go调度器 G-P-M 模型的设计者的文档或直接看源码

参考: ()

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GPM是什么意思呢?

有多种释义,包括计量单位,著名纸模型品牌等等。在生物医学领域,GPM是The Global Proteome Machine的缩写,其支持的生物信息学开源软件项目X!Tandem在蛋白质组学方面有很强的应用性。

另外,“GPM”也可解释为“良好的生产规范”,是药品、食品等行业强制执行的标准,是在生产过程中对产品质量及卫生安全实施自主管理的制度。

扩展资料

G、P、M 是 Go 调度器的三个核心组件,各司其职。在它们精密地配合下,Go 调度器得以高效运转,这也是 Go 天然支持高并发的内在动力。今天这篇文章我们来深入理解 GPM 模型。

先看 G,取 goroutine 的首字母,主要保存 goroutine 的一些状态信息以及 CPU 的一些寄存器的值,例如 IP 寄存器,以便在轮到本 goroutine 执行时,CPU 知道要从哪一条指令处开始执行。

当 goroutine 被调离 CPU 时,调度器负责把 CPU 寄存器的值保存在 g 对象的成员变量之中。

当 goroutine 被调度起来运行时,调度器又负责把 g 对象的成员变量所保存的寄存器值恢复到 CPU 的寄存器。

参考资料来源:百度百科-gpm

2020-08-20:GO语言中的协程与Python中的协程的区别?

福哥答案2020-08-20:

1.golang的协程是基于gpm机制,是可以多核多线程的。Python的协程是eventloop模型(IO多路复用技术)实现,协程是严格的 1:N 关系,也就是一个线程对应了多个协程。虽然可以实现异步I/O,但是不能有效利用多核(GIL)。

2.golang用go func。python用import asyncio,async/await表达式。

评论

Go语言有什么好用的IDE吗

我喜欢jetbrains系列的IDE+go插件。不过我要说的是这个问题主要看你的观点如何。

说eclipse:

构建方式是使用go install 命令,每一次编译运行都是go install。这样的好处就是如果你有很多的包,下载下来并没有编译,这样每次编译速度是很快的。而且(!)go install 符合go官方的项目结构,官方说过了,一个go的项目应该是以个gopath,包含src,pkg,bin三个主要目录。所以说go install个人认为才是主要的go编译方式。

说eclipse的缺点:

其实eclipse插件的go编译方式,还有目录结构,项目结构,都是非常完美的!!!!真的很完美!可是,他的代码提示,太差件!大括号都不能自动补全,gdb 32bit 64bit兼容问题,eclipseC++ 没有html js插件,需要手动安装,几乎不能开箱即用。不过如果你是开发算法,数据处理,还是推荐eclipse的,毕竟其他都无关紧要。

说jetbrains:

说先说clione肯定不适合,新建项目没有向导,导致改成go项目各种不开心,比如图标对于我来说就无法接受go lib 不是小耗子~这是次要的,重要的是各个文件都是灰色的(没有在cmake中包含的结果),然后说剩下的,phpstorm这个不说了,估计很少有人插件按在这里,webstorm,体验也不是很好,idea?体验很好,可是毕竟比较重,尤其是现在加入了自家的K啥玩意(无意冒犯,没记住单词)~可是话说回来,go跟C系列IDE配合才是最佳,跟java系列一点不搭关系,用idea似乎有点格格不入,但是!idea支持新建项目向导,lib的图标也很清晰,最后还是选择idea吧,期待clion的强大起来!

再说jetbrains系列缺点:

插件的构建方式是go buiild 这个让人很不爽,我们几乎不确定会构建到什么地方去,还要每次设置一下run配置。这个可能无关紧要,毕竟不是什么大的毛病,可是go build不能缓存.a文件,直接构建的结果就是很多第三方包的情况下很慢!所以建议安装包的时候手动install 一下解决这个问题。自带代码格式化,这个格式化跟go 格格不入,总的来说就是蛋疼,心碎,菊花痒。

最后说liteIDE:

轻量级IDE,我可以说是国人GO伟大作品典范,然而默认构建也是go build,项目管理方式不符合go官方标准。代码提示不能自动导入(eclipse也不能),不过如果你的项目是以包为单位的,那么另当别论。一定很不错,毕竟是轻量级专门针对GO的IDE!

说这些,其实还有很大一部分取决于你的项目是用vendor机制管理,还是godeps机制管理依赖关系。go不像java拥有强大的几乎天下一统的maven(无意冒犯,暂不评价其他构建套件)。

go没有官方包仓库。

go没有官方包管理工具。

go没有官方自动化构建套件。

上面三个没有是致命要害。导致民间各种百花齐放。

说说我的项目怎么管理

gpm 一个shell工具(windows下你可以用git的bash,或者cygwin~)

我是严格艳照官方推荐方式管理go项目,一个go项目一个gopath。系统的gopath只是为了安装go命令,我没有配置gobin,意义不大。

项目的依赖跟我的代码包都在src下(非vendor)

vendor用来存放包的特殊依赖,发布项目直接把依赖包发布上去(公网管理则只上传依赖关系文件 godeps文件)

资源文件等都放在src目录同级,编译文件放在bin,引用直接../引用。


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